一方、武士の間でも、承久の乱の後に学問を好む風潮が高まったことで、北条泰時の甥（おい）にあたる北条実時（ほうじょうさねとき）が、鎌倉の港であった金沢（かなざわ）の地に私設の図書館となる金沢文庫（かなざわぶんこ）を建てて、和漢の優（すぐ）れた書を集めて学問に励みました。また、鎌倉時代中期までには幕府の歴史を編年体でつづった吾妻鏡（あづまかがみ）も成立しています。

なお、鎌倉時代の末期には宋の朱熹（しゅき）によって広まった儒学（じゅがく）の一つである宋学（そうがく）が伝わりました。朱子学（しゅしがく）とも呼ばれた宋学における、臣下として守るべき道義（どうぎ）や節度（せつど）などのあり方を示した大義名分論（たいぎめいぶんろん）は後世に大きな影響を与え、鎌倉幕府に対する討幕（とうばく）運動への思想的な支柱（しちゅう）となりました。

同じく末期の頃には、伊勢神宮の外宮（げくう）の神官であった度会家行（わたらいいえゆき）によって独自の神道（しんとう）理論である伊勢神道（いせしんとう、別名を度会神道＝わたらいしんとう）が生まれました。

度会家行は、著書である類聚神祇本源（るいじゅうじんぎほんげん）の中で、従来の本地垂迹説（ほんじすいじゃくせつ）に対して、逆に仏が神の化身（けしん）としてこの世に現れたとする神本仏迹説（しんぽんぶつじゃくせつ、別名を反本地垂迹説）を唱えています。

　　　　　　

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