農業以外の諸産業の発達にも著しいものがありました。例えば、漁業では地曳網（じびきあみ）などの網漁法（あみぎょほう）が全国に広がり、上総九十九里浜（かずさくじゅうくりはま）の鰯漁（いわしりょう）や肥前五島（ひぜんごとう）の鮪漁（まぐろりょう）、蝦夷地（えぞち）の松前（まつまえ）での鰊漁（にしんりょう）などが有名になりました。

特にイワシは干鰯（ほしか）に加工され、農業における金肥（きんぴ）として各地へ運ばれました。

江戸時代の初期から土佐（とさ）や紀伊（きい）を中心に網（あみ）や銛（もり）を使用した捕鯨（ほげい）が行われ、捕（と）れたクジラからつくられた鯨油（げいゆ）は灯油のほか害虫の駆除（くじょ）に使用されました。また中期以降には土佐で鰹漁（かつおりょう）が発達しました。

蝦夷地では昆布（こんぶ）の漁獲量（ぎょかくりょう）が増加したほか、イリコ（ナマコの腸を取り出して煮た後に乾燥させたもの）・ホシアワビ（アワビの身を取り出して煮た後に乾燥させたもの）・フカノフレ（サメのヒレを乾燥させたもの）を俵（たわら）につめた俵物（たわらもの）が生産され、俵物は17世紀末以降の長崎貿易において銅に替わる清国への主要な輸出品となりました。

製塩業（せいえんぎょう）では播磨（はりま）の赤穂（あこう）などの瀬戸内地方（せとうちちほう）を中心に、高度な土木技術を必要とする入浜塩田（いりはまえんでん）が発達し、生産量が増大しました。

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都市の発達による建築資材の需要増加に伴（ともな）って林業も急速に発達し、江戸時代中期には蝦夷地にまで産地が広がる一方で、幕府や藩が管轄（かんかつ）する山林から伐採（ばっさい）された材木が商品化しました。尾張藩（おわりはん）の木曽檜（きそひのき）や秋田藩（あきたはん）の秋田杉（あきたすぎ）が有名です。なお、山林の保護のために植林も行われました。

鉱山業では、江戸時代初期には佐渡金山（さどきんざん）や生野銀山（いくのぎんざん）・石見銀山（いわみぎんざん）などからの金銀の生産が最盛期を迎えましたが、17世紀後半になると産出量が激減し、替わって銅が採掘（さいくつ）の中心となりました。

銅は幕府が管轄する足尾銅山（あしおどうざん）や、大坂の町人である泉屋（いずみや）が経営した別子銅山（べっしどうざん）などで採掘され、長崎貿易における輸出品や、急増する貨幣の鋳造（ちゅうぞう）に用いられました。なお、泉屋は現在の住友（すみとも）につながっています。

この他、砂鉄（さてつ）を採集して足踏（あしぶ）み式の送風装置（そうふうそうち）を持つ炉（ろ）を使用したたたら精鉄（せいてつ）が中国・東北地方を中心に行われ、生産された玉鋼（たまはがね）は商品として全国に普及（ふきゅう）し、農具や工具に加工されました。

　　　　　　

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手工業が発達した畿内（きない）においては、河内（かわち）の木綿（もめん）や近江（おうみ）の麻、奈良の晒（さらし）などの織物の名産地が生まれました。特に京都の西陣（にしじん）では、高度な技術を必要とする高機（たかばた）による西陣織（にしじんおり）の絹織物が有名です。なお、絹織物は18世紀中頃には上野（こうずけ）の桐生（きりゅう）など北関東でも生産されました。

和紙の生産も、楮（こうぞ）を主原料とした流漉（ながしすき）の技術が普及したことで全国に拡大し、紙が安価で大量に入手できるようになったことで、学問や文化の発達に貢献（こうけん）することになりました。また紙の生産地の多くは藩の専売制（せんばいせい）となり、財政を助けました。

陶磁器（とうじき）では、肥前有田（ひぜんありた）で有田焼（ありたやき、別名を伊万里焼＝いまりやき）と呼ばれた磁器（じき）が佐賀藩の保護のもとで生産され、長崎貿易における輸出品になったほか、尾張（おわり）の瀬戸（せと）や美濃（みの）の多治見（たじみ）などでも生産されたことで、安価な陶磁器が量産されるようになりました。

醸造業（じょうぞうぎょう）では伏見（ふしみ）・灘（なだ）の酒や野田（のだ）・銚子（ちょうし）の醤油（しょうゆ）が有名となり、この他にも全国各地で作られた商品は、それぞれの地域に由来した特産品（とくさんひん）として重宝（ちょうほう）されました。

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